Корабль приземлился в 147 км юго-восточнее Жезказгана в 17:10 мск.
Ранее представитель Центра управления полетами (ЦУП) в разговоре с ТАСС сообщил, что спускаемая капсула космического корабля «Союз МС-03» вошла в плотные слои атмосферы Земли. Отстыковался от МКС и начал путь к Земле космический грузовик днем 2 июня.